为加快新疫苗、新药的研发和上市,国内科技公司向科研机构免费开放 AI 算力!

跟着我国疾控中心成功别离出新式冠状病毒,人们对该病毒的知道越来越深,相关的疫苗和特效药的研制也在紧锣密鼓地进行中。但是,这一进程需求许多的数据剖析、文献挑选和超算作业支撑。

为了进一步加快新疫苗、新药的研制和上市,国内许多科技公司纷繁向科研组织免费敞开自己的 AI 算力。

阿里云

2020 年 1 月 29 日晚间,阿里云宣告在疫情期间向全球公共科研组织免费敞开全部 AI 算力。

阿里云高性能核算团队担任人何万青解释道:

一般来说,一款药物的研制需求经过毒株别离、测序剖析、找到病毒的靶点进行辨认和验证、寻觅对应化合物、点评研讨和动物试验、制剂组成、临床试验以及上市等进程。

总而言之,药物研制的进程都需求投入许多的金钱、人力以及时刻。据了解,在美国研制一种新的药物,从这个研制项目启动到其终究经过 FDA(Food and Drug Administration,美国食物药物监督管理局)的同意,均匀需求花费 10 -15 年时刻,耗资超越 13 亿美元。 

加快新冠肺炎药物研制,BAT 滴滴向科研组织免费敞开 AI 算力
研讨人员对新式冠状病毒进行毒株别离

现在,本次新式冠状病毒疫苗和特效药的研制现已完成了毒株别离以及基因测序,这一部分作业主要是在试验室进行研讨作业;而接下来的研制,包含对病毒靶点进行辨认和验证、寻觅对应化合物等,都需求云核算的协助。

何万青对媒体说道:

特别是寻觅对应化合物,一定要调用超大规模算力,由于可供制成药物的化合物有 5000-15000 种。要先从杂乱的化合物中找到针对病毒适宜的“进攻方向”,再进行组成和拼接,假如都要从试验室里逐个比对,那就太浪费时刻了。

在阿里云这次敞开 AI 算力之后,全球公共科研组织无需“排队”,随时可以在弹性弹性、数据沟通和发布都愈加快捷的协同环境中作业。

其他,在挑选医学文献和剖析前史数据时,AI 算力也能派上用场。此前相似的 SARS 等疫情迸发后,医学界留有许多的前史药物研制以及临床数据,还有许多医学文献散落全球各地,这些都可能成为这次新式冠状病毒医治突破口。

腾讯

2020 年 1 月 30 日,腾讯官方宣告向北京生命科学研讨所/清华大学生物医学穿插研讨院的黄牛教授试验室、中山大学药学院的罗海彬教授团队供给免费的运超算才能、运算集群支撑以及根底的云核算才能;一起建立应急作业小组,协助加快疫苗研制和新药筛查。

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上述两个由腾讯供给算力支撑的团队正承当新冠肺炎的药物挑选和病毒骤变猜测作业。

早前,国家科技部紧迫启动了相关的应急研讨项目,中山大学药学院罗海彬教授团队当选了“2019-nCoV的保护性抗体、疫苗研制和药物挑选与点评研讨”的课题,担任遴选具有医治效果的候选药物等作业。

为此,腾讯云敏捷调度了一批 GPU 服务器节点,并为罗教授团队开通了高性能核算账号,免费供给一切核算资源,支撑罗教授的团队进行反抗新式冠状病毒的药物挑选和病毒骤变猜测。

一起,北京生命科学研讨所/清华大学生物医学穿插研讨院黄牛教授试验室, 正在推动根据新式冠状病毒靶标结构的化合物虚拟挑选的作业。

腾讯为此供给了许多规范的 CPU 算力以及目标贮存才能,协助黄牛教授试验室进行根据结构的药物分子规划的离线核算使命。针对新式冠状病毒的多个靶点,黄牛教授试验室经过腾讯云秒级交给的海量高性能核算、存储资源,快速核算挑选数亿级其他化合物数据库,结合试验验证,来寻觅新式结构类型的先导化合物,为下一步新药研制作业供给根据。

总而言之,腾讯云较强的 CPU 以及 GPU 算力调度才能可以为基因测序、医疗工程供给安稳高效的算力支撑,然后下降立异药物前期研制的本钱与周期。

百度

加快新冠肺炎药物研制,BAT 滴滴向科研组织免费敞开 AI 算力

紧随阿里和腾讯的脚步,百度研讨院也在 2020 年 1 月 30 日宣告,将向各基因检测组织、防疫中心及全世界科学研讨中心免费敞开线性时刻算法 LinearFold 以及世界上现有最快的 RNA 结构猜测网站,以进步新式冠状病毒 RNA 空间结构猜测速度,然后助力疫情防控。

具体来说,2019 年 7 月,百度初次提出 LinearFold 算法,该算法让整序列、整基因组的 RNA 结构猜测成为可能,也是 RNA 结构猜测范畴的一次重大突破。

此次引起武汉肺炎的新式冠状病毒与 SARS 病毒、艾滋病毒、埃博拉病毒、流感病毒相同,都归于 RNA 病毒,其单链结构导致病毒更简单变异、不易开发疫苗。但假如医学专家们可以愈加快速且深化地了解新冠肺炎基因组的性质,这将为针对性药物的规划研制供给重要信息。

传统上,RNA 二级结构猜测需求三次方时刻复杂度的算法。比如说,序列长度翻一倍就要支付 8 倍的核算时刻,像 RNA 病毒基因组这样的超长序列(例如,艾滋病毒有约 1 万个碱基,埃博拉病毒有约 2 万个碱基)需求很长一段等待时刻。而冠状病毒(包含非典病毒和这次的新式冠状病毒)的基因组又是一切 RNA 病毒里最长的,长达 3 万个碱基,最快的经典算法也需求 55 分钟。

不过,经过百度 LinearFold 算法,这一核算时刻被紧缩到了 27 秒,相当于进步了 120 倍。与此一起,百度还向全球科学家免费敞开了其 RNA 结构猜测网站。这些都将进步基因检测、疫苗研制等科研中心的作业效率,让病毒的研讨及疫苗开发速度快速进步。 

值得一提的是,在此之前,百度还宣告建立总规模 3 亿元疫情及公共卫生安全攻坚专项基金,用于支撑新式冠状病毒肺炎等新疾病的治好药物挑选、研制等一系列抗击疫情作业。

滴滴云

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图片来源于滴滴云

2020 年 2 月 1 日,滴滴也加入了 BAT 的队伍——滴滴云宣告,在通力保证正常服务的根底上,建立应急战疫小组,并免费向国内科研组织、医疗及救助渠道等敞开用于抗击疫情相关作业的 GPU 云核算资源和技术上的支撑,包含但不限于 GPU 云服务器、负载均衡 SLB、弹性公网 EIP 等以及相关的技术上的支撑服务。

疫情期间,国内任何针对本次新式冠状病毒研讨、药物开发的公共科研组织,医院、校园、以及线上医疗渠道、免费教育资源供给方、防疫资源救助等相关渠道,都可联络滴滴云。

滴滴云表明,其将在第一时刻全力合作,供给资源与技术上的支撑,为打好疫情防控战争贡献力量。

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